There are 22 repositories under sars-cov-2 topic.
Data on COVID-19 (coronavirus) cases, deaths, hospitalizations, tests • All countries • Updated daily by Our World in Data
🦠 Huge collection of useful projects and resources for COVID-19 (2019 novel Coronavirus)
Models of COVID-19 outbreak trajectories and hospital demand
COVID-Net Open Source Initiative
Folding@home COVID-19 efforts
🫁 The world's first open-source ventilator tested on human patients. Mass-producible at a low cost (~2000€).
Models of SEIRS epidemic dynamics with extensions, including network-structured populations, testing, contact tracing, and social distancing.
query stats of infected coronavirus cases
Julia and Python complex system applications in ecology, epidemiology, sociology, economics & finance; network science models including Bianconi-Barabási, Barabási-Albert, Watts-Strogatz, Waxman Model & Erdős-Rényi; graph theory algorithms involving Gillespie, Bron Kerbosch, Ramsey, Bellman Ford, A*, Kruskal, Borůvka, Prim, Dijkstra, DSatur, Randomized Distributed, Vizing, Topological Sort, DFS, BFS
Real-time updates and information about key SARS-CoV-2 variants, plus the scripts that generate this information.
A global collection of Open Source projects during COVID-19
Viral genome alignment, mutation calling, clade assignment, quality checks and phylogenetic placement
Unified COVID-19 Dataset
Gemäß Impfverordnung sind alle Impfdaten täglich dem Robert Koch Institut (RKI) zu melden. Die Impfkampagne wurde in ihrem Verlauf um immer weitere Leistungserbringer erweitert, für die mehrere Meldeportale eingerichtet wurden, die in diesem Dokument beschrieben werden.
PyRoss: inference, forecasts, and optimised control of epidemiological models in Python
COVID-19 Detection Chest X-rays and CT scans: COVID-19 Detection based on Chest X-rays and CT Scans using four Transfer Learning algorithms: VGG16, ResNet50, InceptionV3, Xception. The models were trained for 500 epochs on around 1000 Chest X-rays and around 750 CT Scan images on Google Colab GPU. A Flask App was later developed wherein user can upload Chest X-rays or CT Scans and get the output of possibility of COVID infection.
COVID-Net Open Source Initiative - Models and Data for COVID-19 Detection in Chest CT
A collaborative review of the emerging COVID-19 literature. Join the chat here:
Evidence SARS-CoV-2 Emerged From a Biological Laboratory in Wuhan, China
Assembly and intrahost/low-frequency variant calling for viral samples
Informal summaries of notable SARS-CoV-2 lineages
A simple, decentralized. privacy-reserving contact tracing system
Automated Data Collection: COVID-19/SARS-COV-2 Cases in EU by Country, State/Province/Local Authorities, and Date
Im Datensatz 'COVID-19-Hospitalisierungen' werden die aktuellen Zahlen der nach den Vorgaben des Infektionsschutzgesetzes - IfSG - erfassten hospitalisierten COVID-19-Fälle bereitgestellt.
A repository for sharing information on available COVID-19 RNA-Seq datasets
Der vorliegende Datansatz enthält umfassende Informationen zu SARS-CoV-2-Infektionen in Deutschland, die gemäß dem Infektionsschutzgesetze (IfSG) von den Gesundheitsämtern an das Robert Koch-Institut (RKI) gemeldet wurden. Die Daten umfassen Informationen zur Anzahl der bestätigten Fälle, Todesfälle und Genesungen.
Das Nowcasting erstellt eine Schätzung des Verlaufs der Anzahl von bereits erfolgten SARS-CoV-2-Erkrankungsfällen in Deutschland unter Berücksichtigung des Diagnose-, Melde- und Übermittlungsverzugs.
Das Robert Koch-Institut stellt Systeme zur bundesweiten molekularen Surveillance des SARS-CoV-2-Virus bereit. Jedes Labor in Deutschland, das SARS-CoV-2 sequenziert, ist laut der Verordnung zur molekulargenetischen Surveillance des Coronavirus SARS-CoV-2 verpflichtet, dem Robert Koch-Institut die Sequenz- und zugehörige Metadaten zu übermitteln.
COVID-19 infectious forecasting using SEIR model and R0 estimation