infections
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robert-koch-institut / SARS-CoV-2-Infektionen_in_Deutschland_Archiv
Der vorliegende Datansatz enthält umfassende Informationen zu SARS-CoV-2-Infektionen in Deutschland, die gemäß dem Infektionsschutzgesetze (IfSG) von den Gesundheitsämtern an das Robert Koch-Institut (RKI) gemeldet wurden. Die Daten umfassen Informationen zur Anzahl der bestätigten Fälle, Todesfälle und Genesungen.
Das Nowcasting erstellt eine Schätzung des Verlaufs der Anzahl von bereits erfolgten SARS-CoV-2-Erkrankungsfällen in Deutschland unter Berücksichtigung des Diagnose-, Melde- und Übermittlungsverzugs.
Im Datensatz "COVID-19-Hospitalisierungen in Deutschland" des Robert Koch-Institutswerden täglich aktualisierte Informationen zu Hospitalisierungen im Zusammenhang mit COVID-19 basierend auf den Meldungen nach dem Infektionsschutzgesetz (IfSG) bereitgestellt. Neben tagesaktuellen Fallzahlen und Inzidenzen auf Bundes- und Länderebene enthält der ...
Im Datensatz "SARS-CoV-2 Infektionen in Deutschland" des Robert Koch-Instituts werden die Daten basierend auf Meldungen zu SARS-CoV-2 Infektionen nach dem Infektionsschutzgesetz (IfSG) bereitgestellt. Darin enthalten sind Informationen auf Landkreisebene zu bestätigten Infektionen, Todesfällen und Genesungen, differenziert nach Altersgruppen und...
- Language:Shell 10
Im Datensatz "7-Tage-Inzidenz der COVID-19-Fälle in Deutschland" des Robert Koch-Instituts werden die täglich aktualisierten COVID-19-Inzidenzen auf Bundes-, Landes- und Landkreisebene basierend auf den Meldungen nach dem Infektionsschutzgesetz (IfSG) bereitgestellt. Die 7-Tage-Inzidenz wird definiert als Anzahl gemeldeter Fälle der letzten sieb...
- decontaminer
amarinderthind / decontaminer
DecontaMiner is a tool designed and developed to investigate the presence of contaminating sequences in unmapped NGS data. It can suggest the presence of contaminating organisms in sequenced samples, that might derive either from laboratory contamination or from their biological source, and in both cases can be considered as worthy of further investigation and experimental validation. The novelty of DecontaMiner is mainly represented by its easy integration with the standard procedures of NGS data analysis, while providing a complete, reliable, and automatic pipeline. https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-019-2684-x
Language:Perl 9 - NLSIG-COVID19Lab
somefunAgba / NLSIG-COVID19Lab
A nlogistic-sigmoid playground for modelling the COVID-19 pandemic growth
Language:MATLAB 6 TillBeemelmanns / corona-infection-prediction
Simple exponential model for Covid-19 (corona) infections
Language:Python 4beyerleinf / rki-covid-dashboard
COVID-19 Dashboard for Germany powered by RKI data.
Language:TypeScript 2sahib-pratap-singh / Covid-19-indicator
Web based application to analyse the live cases of COVID-19 and its impact on economy
Language:Jupyter Notebook 2- Language:Dart 1
- coviditaly
lefreakcestchic1971 / coviditaly
Notebook contenente l'analisi dei dati relativi alla diffusione del Coronavirus in Italia forniti dalla Protezione Civile. Notebook containing data analysis inherent covid-19 spread in Italy
Language:Jupyter Notebook 1 This repository contains the code for the manuscript Ensemble-labeling of infectious diseases time series to evaluate early warning systems with which you can reproduce the manuscript's results and figures.
Language:Python 1staedi / Streamlit_nCov19
Interactive Dashboard of Novel COVID-19 Using Streamlit for Python
Language:Python 1AHmadProDeveloper / Medicine
This is a website about medicine and diseases
Language:HTML 0- Language:C# 0
eckelmannf / COVID-19-Hospitalisierungen_in_Deutschland
Im Datensatz 'COVID-19-Hospitalisierungen' werden die aktuellen Zahlen der nach den Vorgaben des Infektionsschutzgesetzes - IfSG - erfassten hospitalisierten COVID-19-Fälle bereitgestellt. Um den Trend der Anzahl von Hospitalisierungen und der 7-Tage-Hospitalisierungsinzidenz besser bewerten zu können, wird die berichtete Hospitalisierungsinzidenz um eine Schätzung der zu erwartenden Anzahl an verzögert berichteten Hospitalisierungen ergänzt. Neben den Daten der gemeldeten COVID-19-Hospitalisierungen auf Bundes- und Länderebene wird daher ein Nowcasting der Anzahl hospitalisierter Fälle und der 7-Tage-Hospitalisierungsinzidenz auf Bundesebene durchgeführt. Ziel ist die Schätzung der Anzahl von hospitalisierten COVID-19-Fällen mit Meldedatum innerhalb der sieben vorhergehenden Tage - inklusive der noch nicht an das RKI berichteten Hospitalisierungen. Aufbauend auf dem Nowcasting wird eine Schätzung der adjustierten 7-Tage-Hospitalisierungsinzidenz durchgeführt.
0RKIOpenData / OpenData_Sandbox
This repository contains the code for the manuscript Ensemble-labeling of infectious diseases time series to evaluate early warning systems with which you can reproduce the manuscript's results and figures.
Language:HTML 0svilens / covid-bulgaria
Dashboard for tracking and analyzing the COVID-19 outbreak in Bulgaria
Language:Python 0aakhmetz / COVID19-Reff-Taiwan-2021
Supporting materials for Akhmetzhanov AR et al. Transmission dynamics and effectiveness of control measures during COVID-19 surge, Taiwan, April–August 2021. Emerg Infect Dis. 2022 Oct
Language:Jupyter Notebookamari-calipso / Visual-SIRD-Simulator
A visual simulator of infection spreading
Language:Opalmagosil86 / spillover-infections
Official repository for the paper "Unpacking sources of transmission in HIV prevention trials with deep-sequence pathogen data – BCPP/ Ya Tsie study".
Language:R
