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Convert a VCF into a MAF, where each variant is annotated to only one of all possible gene isoforms
HgvsGo is a program designed for analyzing "c." and "p." HGVS (Human Genome Variation Society) notations for single nucleotide variations (SNVs) and small insertions/deletions (indels) after variant calling. It serves as an alternative to tools like snpEff and VEP.
C# program to superpose SSVEP and c-VEP flickers on top of other graphical interfaces
GATK 4 Mutect2 Somático
Pipeline for variant annotation using Variant Effect Predictor (VEP)
Gaze data -based epoch selection algorithm for eye tracker assisted visual evoked potential paradigm
population structural variant calling with smoove
VEP Community Tool to visualise VEP data using neXtProt tools.
Visually evoked potentials and P300 for the Attys (Windows/Linux)
Variant annotation of vcf file using exac and vep
Variantes genéticas de amostras de Rattus norvegicus utilizando GATK4
Anotação de VCF somático utilizando a ferramenta VEP ensembl 105 desenvolvido para tarefa avaliativa
For ear EEG testing and verifying
Python script providing summary of CADD scores conditioned on several options
Personal Cancer Genome Reporter (PCGR)
The python package helps you analyze Variant Effect Predictor (VEP) result.
En este programa se realice la detección del parpadeo por medio del algoritmo de Viola-Jones. Esto programa se realiza como un soporte para un sistema de adquisición de señales EEG, para la obtención de la señal mfVEP. El programa se encarga de detectar cuando la persona realiza un parpadeo, al detectar el mismo se encarga de mandar un trigger al sistema de adquisición de datos para poder tener un control de en que momento se realizo el parpadeo y poder descarta esa fragmento de la señal en la etapa de preprocesado.