zoukai214 / CT-Synthetic-MR-Images

input ct data use U-net method systh mri

ct_to_mri

input ct data use U-net method systh mri

来自论文《Whole Brain Segmentation and Labeling from CT Using Synthetic MR Images》，主要用于通过分割模型，将CT数据合成MRI数据。

运行环境

keras>1.3 Tensorfow>1.0 SimppleITK=1.1.0

数据收集

收集同一人的CT/MRI数据，需要对数据进行N4偏差场矫正，白质均值正则化，再讲两个数据进行刚性配准。

模型的修改

按上图对Unet进行修改，参考unet_model.py文件

数据预处理

如上图对CT,MRI数据进行数据预处理

训练

train.py