miura / TheDigitalCell

Code associated with The Digital Cell

Geek Repo:Geek Repo

Github PK Tool:Github PK Tool

デジタル細胞生物学

データベース化・ImageJ・R・コマンドライン・Git

このリポジトリでは、本で扱っているコンピュータプログラム、サンプル画像を公開している。

DOI

このリポジトリにあるフォルダは、それぞれ本の各章に対応しており、その章で扱っているコード例が収められている。コードには本の中で登場する順番に番号が振られている。番号が振られていないコードは、日本語版の出版にあたって加えたコードであり、付録で扱うコードである。また、日本語版用に新たにSamplesというフォルダを加え、チュートリアル用のサンプル画像が収められている。 これらのコードは次のいずれかの言語で書かれている。

  1. Fiji/ImageJで実行するためのImageJマクロ
  2. RStudio/Rで実行するためのRスクリプト
  3. コマンドラインで実行するためのBashスクリプト

なお、オリジナルの英語版のリリースは、以下のリンクからアクセスできる。

DOI

出版後の訂正

訂正箇所がいくつかあります。以下の文書を御覧ください。

訳文の訂正

About

Code associated with The Digital Cell

License:GNU General Public License v3.0


Languages

Language:R 52.7%Language:ImageJ Macro 41.7%Language:Shell 5.6%