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実験医学別冊 RNA-Seqデータ解析 3章(2) リファレンスゲノムにマッピングしない方法

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Chapter3_2

実験医学別冊 RNA-Seqデータ解析 3章(2) リファレンスゲノムにマッピングしない方法

DAG

計算環境

このパイプラインは、CentOS Linux release 7.2.1511 (Core)上で実行されました

マシンスペックは、Intel Xeon E5-2697 v2 (2.70 GHz) 、128GB RAMです

準備

  • Snakemake: 5.28.0
  • Docker: 17.09.0-ce, build afdb6d4
  • Singularity: 3.5.3

実行

snakemake -j 4 --use-singularity

About

実験医学別冊 RNA-Seqデータ解析 3章(2) リファレンスゲノムにマッピングしない方法


Languages

Language:Python 45.4%Language:R 37.1%Language:Shell 17.5%