JHermosillaD / Microalgae

Study of the movement of the microalga Chlorococum sp.

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Microalgae 🌱 🔬

Estudio del movimiento de la microalga Chlorococum sp.

Acerca de

Dentro del Laboratorio de Materiales Blandos, Simulación y Cálculo Numérico se obtuvieron diversas grabaciones de la actividad de las microalgas bajo un ambiente controlado.


Pre-procesamiento

A través de Fiji se extrajeron los fotogramas y se realizó un pre-procesamiento de los datos que consistió en:

  • Reducir las imágenes a 8-bits
  • Aplicar un filtro gaussiano para reducir el ruido
  • Establecer un umbral y aplicar una máscara binaria para aislar las microalgas

Análisis

Posteriormente se calculó el centroide de cada una y se obtuvo le tracking de las posiciones durante toda la grabación.

El análisis estadístico permitió obtener el coeficiente de difusión, i.e, la dinámica asociada a la interacción.

About

Study of the movement of the microalga Chlorococum sp.


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