Luiz Vieira's repositories
Aprendendo_R
Estes notebooks em R são um compilado dos meus estudos e pesquisa em linguagem R. Espero que ajude outros nos seus estudos também.
bash_Unix_Conda
Here I share with all of you, a list of usefull bash commands used in unix systems. Also, I introduce a alternative to use UNIX systems in windows PCs.
lncov1_Transcriptome_Analysis
Here we provide the pipeline used in the transcriptome analysis described in the paper "A long non-coding RNA is a key factor in the evolution of insect eusociality"
Analise-exploratoria-dados_COVID19BR
Análise exploratória dos dados da COVID-19 no Brasil, usando as principais ferramentas da linguagem python.
Analise_dados_vacinacao_covid19_SQL_e_Python
Este material tem o propósito de aprendizagem, com o intuito de colocar em prática conceitos sobre a linguagem SQL, Python e análise de dados.
Analisys_QC_sequencing_batches
The data analysed containing sample quality control information for 300 sequencing batches. Then this data metrics were used to flag bad samples.
Aprendendo_Python
Este repositório foi desenvolvido com o intuito de servir para consultas rápidas de conceitos e exemplos da linguagem python.
bioinfo-notebook
🔬 Bioinformatics Notebook. Scripts for bioinformatics pipelines, with quick start guides for programs and video demonstrations.
DMS_ML_AMP
Deep mutational scanning and machine learning uncover antimicrobial peptide features driving membrane selectivity
Rna-Seq_Workflow
Neste projeto descrevo diferentes parâmetros e opções para a execução de programas necessários à análise de Rna-Seq, além de incluir informações e opniões que possam facilitar a escolha da melhor opção que se adque à análise em questão.
Variant_Call_sars-cov-2
A chamada de variantes envolve a identificação de polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) e pequenas inserções e deleções (indels) em dados de Sequenciamento de Nova Geração (NGS). Nesta pipeline descrevo a detecção de SNP para identificação de possíveis alterações de aminoácidos em proteínas virais.
bioinformatics_tools
Here, I share notebooks, scripts and mardown files describing bioinformatics tools to analyse biological data.
DMS_iDCT
This repository is focus on applying a different method to represent a sequence embedding, rather than averaging.
Protegrin-1_Slay_and_ML
W3110_PG-1 Project Workflow
Rosalind-Problems
Rosalind is a platform for learning bioinformatics and programming through problem solving. So, here I show you my way to solve those problems.