##README
○r_script_clus.Rの使い方
1.スクリプトファイルをローカル環境に置く
作業フォルダに該当スクリプトを置く。作業フォルダは、getwd()で確認可能。任意の場所に置いてから、setwd()関数でそのフォルダを指定しても良い。
2.スクリプトの適用
R上で source("r_script_clus.R")の実行
3.スクリプトの実行
スクリプトには、cls.rank関数が定義されており、データ(教師無し)とクラスタ数を指定して呼び出す。例えば、cls.rank(データ,5)と呼び出す。
クラスタ数は、デフォルト値=3を指定しているため、デフォルトで良ければ、別途指定する必要はない。 戻り値は、各クラスタの重心に近いデータポイントを5つまで(5は固定)表示する。 下記は、irisデータをクラスタ=3で、cls.rank関数を呼び出した結果である。 (種別は無し)に、該当クラスタ(cls)とクラスタの中心からの距離(dist)が追加されたデータが表示される。 下は距離の昇順に並んでいる。
Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width cls dist
1 5.0 3.4 1.5 0.2 1 0.06618157
2 5.1 3.4 1.5 0.2 1 0.11480418
3 5.1 3.5 1.4 0.2 1 0.14135063
4 5.1 3.5 1.4 0.3 1 0.14415270
5 5.0 3.3 1.4 0.2 1 0.14959947
6 6.0 2.9 4.5 1.5 2 0.21993519
7 5.7 2.8 4.5 1.3 2 0.26937898
8 5.9 3.0 4.2 1.5 2 0.32426175
9 5.7 2.9 4.2 1.3 2 0.34498790
10 6.2 2.9 4.3 1.3 2 0.37241653
11 6.8 3.0 5.5 2.1 3 0.25958095
12 6.9 3.2 5.7 2.3 3 0.26952816
13 6.7 3.3 5.7 2.1 3 0.27627819
14 7.1 3.0 5.9 2.1 3 0.30610139
15 6.8 3.2 5.9 2.3 3 0.30952112