xomaiya / BP-kinetics

Modeling the interaction of a pyramidal and basket neurons

Моделирование динамики синаптически связанных пирамидального и корзинчатого нейрона

Содержание файлов проекта:

BP_dynamics.py

ОДУ и их интеграторы

draws.py

Отрисовка сигналов, фазового портрета, вейвлет-преобразования и автокорреляционной функции

wavelets.py

Основные функции для расчета вейвлет-преобразования Морле и приложений

multistability.py

Функция для расчета ISI, гистограммы ISI при разных Н.У., карты режимов

lyapunov_exponents.py

Вычисление старшего показателя Ляпунова, его статистики и спектра показателей Ляпунова

Poincare.py

Отрисовка отображения Пуанкаре (2D и 3D), бифуркационной диаграммы, а также расчет периода, матрицы монодромии и мультипликаторов (как собственные значения матрицы монодромии)

Замечания

Показатели Ляпунова и отображение Пуанкаре можно использовать для любой системы в общем случае. Для этого необходимо определить функцию $calcODE()$, которая будет конструировать ОДУ и интегрировать его.