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一键完成某项任务的脚本

bioinfo_tools（python3）

一键完成某项任务的脚本(重造轮子)

1. kegg富集分析脚本

必备文件为geneid2symbol, hsa00001.keg, diff_gene.txt(可以为symbo或geneid)
放置同一文件夹后一键运行python kegg.py即可产生kegg_enrichment_result文件夹, 含有csv和png文件

kegg富集结果图如下:
参考：
http://www.biotrainee.com/thread-1347-1-1.html
http://www.cs.tau.ac.il/~rshamir/ge/09/scribe/lec14a.pdf
https://guangchuangyu.github.io/cn/2012/04/enrichment-analysis/

2. kegg通路图动画脚本

输入通路id与要标注的gene_id列表，对应color列表与对应的label列表后可输出通路图，注意label_list可以为None，列表长度相同
通路demo动画图如下:

参考：
https://github.com/ajmazurie/kegg-animate-pathway