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构建医疗实体识别的模型,包含词典和语料标注,基于python构建

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LSTM-CRF-medical

构建医疗实体识别的模型,包含词典和语料标注,基于python构建

数据集合标注

数据集合标注可以基于词典,通过最大匹配获得实体位置,然后标注实体类型。

词典构造

目前构造的词典包括疾病词典、症状词典和身体部位词典。疾病词典包括互联网爬取的疾病名称、疾病别名、ICD10疾病名称,去重后共39615条数据;症状为互联网爬取的症状描述,去重后共7457条数据;身体部位为互联网爬取的身体部位描述,去重后共1929条数据。示例如下:

疾病名称:1型糖尿病性急性牙周脓肿,妊娠合并系统性红斑狼疮,结石性胆囊炎,药物性股骨坏死,晚期梅毒性脉络膜炎,腹型过敏性紫癜

症状:胀痛,耳后长包,睡觉流口水,鼻塞,粉红色泡沫样痰,孕妇气喘,痔疮便血,头昏眼花

身体部位:鼻唇沟,鼻处,鼻子,鼻子尖,鼻孔,鼻尖,鼻窦软骨,鼻翼,鼻黏膜

实体检索

选取了ICD10中的5000条疾病描述,根据已有词典进行实体的最大匹配。

以疾病为例,对于输入的疾病描述进行规范化,去掉空格、换行符,去掉无意义的句头和句尾字词等。

对规范化的句子,使用词典中的每个词进行全匹配,记录匹配的词、词的起始index、词的结束index和实体类型。

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构建医疗实体识别的模型,包含词典和语料标注,基于python构建


Languages

Language:Jupyter Notebook 94.8%Language:Python 3.5%Language:Perl 1.7%