Bem, esse pequeno projeto faz parte de uma série de coisas básicas do dia a dia de um programador/desenvolvedor Java. Algumas coisas serão voltadas mais para Web, mas com algumas adaptações dá pra se usar também para Desktop. Essa foi uma das formas que eu encontrei pra me fazer lembrar caso eu esqueça de algo.
Há inúmeras formas de se fazer isso, talvez essa minha forma não seja uma das melhores, por isso podem mandar sugestões ou pull-requests para que possamos melhorar e aprender.
Aqui está um pequeno exemplo de CRUD com Java Web sem nenhum FrameWork.
Eu estou usando a IDE NetBeans 8.2 e o SGBD PostgreSQL 9.5.
Faça um clone ou fork deste projeto.
Ele construido em cima do Tomcat (a versão que eu estou usando é a 7.0.69, mas se quiser testar com as mais recentes fique à vontade. Uma outra que eu testei também foi a 8.5.11).
Crie um banco de dados chamado java_web_basics e depois rode os scripts dentro da pasta */others/sql* (o arquivos estão enumerados o que significa a ordem de execução).
NOTA: Se for usuário da IDE Eclipse siga estas instruções.