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molecular dynamics simulation and analysis. 分子动力学模拟和分析。

Gromacs模拟协议、轨迹分析、测试分析

Gromacs相关

1. 安装笔记gmx_install.sh
2. 模拟脚本gmx_mpi.sh
3. 模拟设置mdp文件gmx_mdp_files
4. 轨迹分析trajectory_analysis_by_Gromacs

笔记

1. 李毅笔记
2. 梁晶步骤
3. 杜星笔记
4. 元动力学

小技巧

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2. gnuplot绘图技巧gnuplot.md
3. openmm安装openmm.md