likexin323 / Work_flow_of_population_genetics

整理常用的群体遗传学分析流程和脚本

Work_flow_of_population_genetics

在学习中同步整理一些群体遗传学分析中常用的流程和脚本

记录相关流程和脚本方便自己和大家参考
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文中使用的软件需要自行安装，参考软件列表见软件列表 Reference Software List

• SNP 鉴定和SNP特征
  • 序列过滤和比对
  • 获得遗传变异信息以及质量控制
  • 特征统计
• 群体历史推测
  • MSMC算法
  • PSMC算法
• 群体关系计算
  • King计算个体间亲缘关系