易宏基因组(EasyMetagenome)——最简单易学易用的宏基因组分析流程
版本：EasyMetagenome v1.11
更新时间：2021/5/7
文件介绍
- 1SoftDb.sh：软件和数据库安装
- 2Pipeline.sh：分析流程
- 3StatPlot.sh：统计和可视化代码
Shell代码兼容Markdown格式，可使用有道云笔记中Markdown笔记中查看，有目录导航更方便浏览和阅读。
各文档附录部分为常见问题，供参考。
使用方法
在64位版本系统，如Ubuntu 18.04/20.04，CentOS7/8的系统，按代码1，2，3逐步运行
在命令行，或RStudio的Shell环境下使用，可以有道云笔记中显示代码目录，方便预览大纲
引用
使用此流程代码，请引用：
Yong-Xin Liu, Yuan Qin, Tong Chen, Meiping Lu, Xubo Qian, Xiaoxuan Guo & Yang Bai. (2021). A practical guide to amplicon and metagenomic analysis of microbiome data. Protein & Cell 12, 315-330, doi: https://doi.org/10.1007/s13238-020-00724-8