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Proceso, limpieza y estandarización de los datos abiertos de SUSALUD sobre camas en hospitales

Fuente: “Data histórica del Registro de Camas diarias disponibles y ocupadas del formato F500.2” http://datos.susalud.gob.pe/dataset/data-hist%C3%B3rica-del-registro-de-camas-diarias-disponibles-y-ocupadas-del-formato-f5002

Notas

• 2020-09-13: Los datos ahora incluyen in campo extra fecha_registro
• 2020-09-21: Algunos registros no tienen región/departamento asignados
• 2020-12-04: Los datos de hoy tienen 121,600 registros, y los de hace un par de días atras (2020-12-02) eran 76,072. Un aumento de casi el 60% de registros comparando hoy con hace dos días. Parece que los datos posteriores al 2020-11-27 estaban incompletos, y recién se han actualizado en su totalidad.
• 2020-12-05: Hoy se detectaron 220 registros con un incorrecto número de columnas, debido a que el nombre de un hospítal contiene una coma y no esta apropiadamente delimitado por comillas (HOSPITAL DE APOYO II - 2, SULLANA)
• 2020-12-12: Cambio no documentado en el formato de datos de SUSALUD, está ahora usando: |, como separador
  • También, hay 247 registros con errores de formato, pues toda la línea está entre comillas
  • Esto se puede ver en la muestra de datos siguiente

CORRELATIVO|FECHA_CORTE|FECHA_REGISTRO|INSTITUCION|UBIGEO|REGION|PROVINCIA|CATEGORIA|CODIGO|NOMBRE|ZONA_COVID|CAMAS_ZC_OCUPADOS|CAMAS_ZC_DISPONIBLES|CAMAS_ZC_TOTAL|CAMAS_ZNC_OCUPADOS|CAMAS_ZNC_DISPONIBLE|CAMAS_ZNC_TOTAL|UCI_ADULTOS_CAMAS_OCUPADAS|UCI_ADULTOS_CAMAS_DISPONIBLE|UCI_ADULTOS_CAMAS_TOTAL|UCI_PEDIATRIA_CAMAS_OCUPADAS|UCI_PEDIATRIA_CAMAS_DISPONIBLE|UCI_PEDIATRIA_CAMAS_TOTAL|UCIN_CAMAS_OCUPADAS|UCIN_CAMAS_DISPONIBLE|UCIN_CAMAS_TOTAL|CAMAS_HOSP_OCUPADAS|CAMAS_HOSP_DISPONIBLE|CAMAS_HOSP_TOTAL|VENTILADORES_UCI_ZC_OCUPADOS|VENTILADORES_UCI_ZC_DISPONIBLE|VENTILADORES_UCI_ZC_TOTAL|VENTILADORES_UCI_ADULTO_OCUPADOS|VENTILADORES_UCI_ADULTO_DISPONIBLE|VENTILADORES_UCI_ADULTO_TOTAL|VENTILADORES_UCI_PEDIATRIA_OCUPADOS|VENTILADORES_UCI_PEDIATRIA_DISPONIBLE|VENTILADORES_UCI_PEDIATRIA_TOTAL|VENTILADORES_UCIN_OCUPADOS|VENTILADORES_UCIN_DISPONIBLE|VENTILADORES_UCIN_TOTAL
1|20200407|20200407|Privado|040103|AREQUIPA|AREQUIPA|II-1|00015730|CLINICA SAN JUAN DE DIOS|No|0|0|0|0|0|0|1|3|4|0|0|0|0|0|0|15|35|50|0|0|0|1|4|5|0|0|0|0|0|0
2|20200407|20200407|Privado|040101|AREQUIPA|AREQUIPA|II-1|00016744|CLINICA VALLESUR|No|0|0|0|0|0|0|3|1|4|0|0|0|0|0|0|12|39|51|0|0|0|3|1|4|0|0|0|0|0|0
3|20200407|20200407|Privado|060101|CAJAMARCA|CAJAMARCA|II-1|00012761|CLINICA SAN LORENZO S.R.L.|No|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|14|14|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0

...

"91|20200409|20200409|Privado|150132|LIMA|LIMA|II-1|00009090|""CLINICA """" LIMATAMBO""""""|No|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|14|16|30|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0"

...

"150|20200410|20200410|Privado|150132|LIMA|LIMA|II-1|00009090|""CLINICA """" LIMATAMBO""""""|No|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|17|13|30|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0"

...

"125468|20201211|20201211|Privado|150132|LIMA|LIMA|II-1|00009090|""CLINICA """" LIMATAMBO""""""|No|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|8|12|20|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0|0"

...

Reporte rápido de datos

Data summary

Name	susalud_camas
Number of rows	189028
Number of columns	45
_______________________
Column type frequency:
Date	2
factor	11
numeric	31
________________________
Group variables	None

Variable type: Date

skim_variable	n_missing	complete_rate	min	max	median	n_unique
fecha_corte	0	1	2020-04-07	2021-03-30	2020-10-18	358
fecha_registro	0	1	2020-04-07	2021-03-30	2020-10-09	358

Variable type: factor

skim_variable	n_missing	complete_rate	ordered	n_unique	top_counts
mes_corte	0	1	TRUE	12	ene: 17909, dic: 17822, mar: 17703, oct: 17428
dia_semana	0	1	TRUE	7	mar: 27245, lun: 27132, dom: 27046, sáb: 26998
institucion	26	1	FALSE	6	Pri: 85146, Gob: 55020, EsS: 34716, MIN: 9745
ubigeo	26	1	FALSE	234	130: 5857, 150: 5389, 150: 4813, 150: 4643
region	26	1	FALSE	25	LIM: 65870, LA : 16323, ARE: 9362, JUN: 8634
provincia	26	1	FALSE	134	LIM: 60497, TRU: 10643, ARE: 7490, CUS: 5192
distrito	26	1	FALSE	229	TRU: 5857, LIM: 5389, SAN: 4813, MIR: 4643
categoria	26	1	FALSE	11	II-: 73828, II-: 49852, II-: 28652, III: 12145
codigo	0	1	FALSE	592	000: 358, 000: 358, 000: 358, 000: 358
nombre	26	1	FALSE	603	CLI: 710, CLI: 698, CLU: 682, OFT: 566
zona_covid	0	1	FALSE	2	Si: 118725, No: 70303

Variable type: numeric

skim_variable	n_missing	complete_rate	mean	sd	p0	p25	p50	p75	p100	hist
epi_week	0	1	27.97	15.80	1	12	29	42	53	▇▃▇▇▇
camas_zc_ocupados	0	1	2.49	8.96	0	0	0	0	164	▇▁▁▁▁
camas_zc_disponibles	0	1	0.44	1.51	0	0	0	0	45	▇▁▁▁▁
camas_zc_total	0	1	2.93	9.30	0	0	0	2	164	▇▁▁▁▁
camas_znc_ocupados	0	1	16.88	64.28	0	0	0	10	1609	▇▁▁▁▁
camas_znc_disponible	0	1	13.58	44.54	0	0	0	10	2419	▇▁▁▁▁
camas_znc_total	0	1	30.46	94.52	0	0	4	22	2563	▇▁▁▁▁
uci_adultos_camas_ocupadas	0	1	0.82	2.25	0	0	0	0	230	▇▁▁▁▁
uci_adultos_camas_disponible	0	1	0.45	1.28	0	0	0	0	57	▇▁▁▁▁
uci_adultos_camas_total	0	1	1.27	2.86	0	0	0	2	230	▇▁▁▁▁
uci_pediatria_camas_ocupadas	0	1	0.36	2.62	0	0	0	0	47	▇▁▁▁▁
uci_pediatria_camas_disponible	0	1	0.17	0.88	0	0	0	0	83	▇▁▁▁▁
uci_pediatria_camas_total	0	1	0.54	3.03	0	0	0	0	89	▇▁▁▁▁
ucin_camas_ocupadas	0	1	0.85	4.51	0	0	0	0	94	▇▁▁▁▁
ucin_camas_disponible	0	1	0.39	1.78	0	0	0	0	50	▇▁▁▁▁
ucin_camas_total	0	1	1.23	5.82	0	0	0	0	103	▇▁▁▁▁
camas_hosp_ocupadas	0	1	24.72	62.06	0	1	6	22	1788	▇▁▁▁▁
camas_hosp_disponible	0	1	23.07	44.10	0	4	11	24	4052	▇▁▁▁▁
camas_hosp_total	0	1	47.80	93.82	0	8	20	45	4100	▇▁▁▁▁
ventiladores_uci_zc_ocupados	0	1	2.51	8.97	0	0	0	0	164	▇▁▁▁▁
ventiladores_uci_zc_disponible	0	1	0.53	1.70	0	0	0	0	45	▇▁▁▁▁
ventiladores_uci_zc_total	0	1	3.04	9.39	0	0	0	2	164	▇▁▁▁▁
ventiladores_uci_adulto_ocupados	0	1	0.64	1.98	0	0	0	0	230	▇▁▁▁▁
ventiladores_uci_adulto_disponible	0	1	0.45	1.29	0	0	0	0	57	▇▁▁▁▁
ventiladores_uci_adulto_total	0	1	1.08	2.62	0	0	0	1	230	▇▁▁▁▁
ventiladores_uci_pediatria_ocupados	0	1	0.27	2.23	0	0	0	0	47	▇▁▁▁▁
ventiladores_uci_pediatria_disponible	0	1	0.15	0.83	0	0	0	0	33	▇▁▁▁▁
ventiladores_uci_pediatria_total	0	1	0.42	2.70	0	0	0	0	55	▇▁▁▁▁
ventiladores_ucin_ocupados	0	1	0.26	1.75	0	0	0	0	139	▇▁▁▁▁
ventiladores_ucin_disponible	0	1	0.15	0.72	0	0	0	0	21	▇▁▁▁▁
ventiladores_ucin_total	0	1	0.41	1.98	0	0	0	0	139	▇▁▁▁▁

Evolución del número de camas disponibles

Cambio en el uso porcentual de camas en zona COVID-19 a nivel nacional

Cambios en la cantidad de ventiladores UCI en zona COVID-19