确保你的电脑上面安装了make和gfortran, 然后进入src目录下面, 输入:
make 那么默认就会开启openMP并行进行编译. 并获得一个名为target的可执行文件, 如果不想开启openMP并行, 可以输入:
make serial 那么就会获得一个名为target_serial的可执行文件.
通过输入:
export OMP_NUM_THREADS=5 可以将openMP的并行核数设置为5核, 请同学们根据自己的硬件情况进行设置.
获得了可执行文件之后, 在src目录下直接输入可执行文件的名字, 程序就会自动读取parameter.nml文件中的参数并以文件中的参数进行MD仿真. 这里说明一下parameter.nml文件的名字是不能改的, 只有里面的内容可以修改. parameter.nml文件的内容和物理意义如下:
&InputVar
deltaT = 0.002d0 ! 时间步长
density = 0.8d0 ! 原子分布的密度
nx = 50 ! x方向上晶格个数
ny = 50 ! y方向上晶格个数
stepAvg = 100 ! 每隔多少步平均一次物理量
stepEquil = 0 ! 目前仿真中暂时没用到的物理量
stepLimit = 5000 ! 一共循环多少步
temperature = 1.d0 ! 模拟在什么温度下进行
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请同学们根据自己的需要设置对应的仿真参数.