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Computación Paralela 2015 - Semestre II

Maestría en Ingeniería Computacional - Universidad de Caldas

Raúl Ramos-Pollán, Universidad Industrial de Santander, [+info] rramosp@uis.edu.co


Estaremos usando:

  • una máquina virtual configurada para las lecciones 1, 2 y 3, con CentOS 6, OpenMP y Python Anaconda para que puedas realizar de manera independiente tus ejercicios (contáctame para obtenerla)
  • una máquina virtual con la instalación del Spark para la lección 4. Seguiremos parte del contenido del curso en EDX sobre Scalable Machine Learning
  • la infraestructura guane de Centro de Supercómputo y Cálculo Científico de la UIS sobre todo para las pruebas de escalabilidad y uso de CUDA/GPUs (instrucciones de acceso más abajo)

Crea una copia local de este repositorio para trabajar en los ejercicios desde la máquina virtual del curso y lanza tu servidor personal del entorno de ejecución de ipython notebooks

:::console
git clone https://bitbucket.org/rramosp/ucaldas.20152.msc
ipython notebook

Lección 1 - Introducción

Temas: Uso infraestructura SC3-UIS, Paralelismo y computación, Computación distribuida, Arquitecturas de procesadores

Refs: Supercomputación y Cálculo Científico UIS [web site], Caché effects [enlace] , HPC Course @UWisc [enlace]

Ejercicios:

Lección 2 - OpenMP

Temas: Modelo de programación, Variables compartidas y sincronización, Tareas, Optimización

Refs: Tim Mattson, Intel [video lectures, materials], Lista de recursos [enlace]

Ejercicios:

Lección 3 IPython Parallel

Temas: Modelo de programación, Distribución de Tareas, Comunicaciones, Coordinación, Sincronización, Procesamiento de imágenes.

Refs: IPython for Parllel Computing

Ejercicios:

Lección 4 Paralelismo Masivo con Apache Spark

Temas: Modelos de paralelismo en Big Data, Resilient Distributed Datasets, Modelo de programación, Acciones y Operaciones Spark

Refs: Seguiremos parte del curso sobre Scalable Machine Learning en EDX. Los siguientes ProblemSets son parte de los assignments de dicho curso.

Ejercicios:

Uso infraestructura GUANE @ UIS

si, por ejemplo, tu número de estudiante es el 03 usa la cuenta estudiante03 y el puerto 9903 en los comandos siguientes.

Entra en la máquina de salida de la Universidad de Caldas:

:::console
ssh progpara@c-head.ucaldas.edu.co -L9903:localhost:9903

Usa la cuenta compartida para entrar en la máquina toctoc y en la máquina guane que son los puntos de entrada para la infraestructura de la UIS:

:::console
ssh ucaldas@toctoc.grid.uis.edu.co -o ServerAliveInterval=30 -L9903:localhost:9903

ssh ucaldas@guane -L9903:localhost:9903

Una vez en guane, usa tu cuenta para entrar en la máquina reservada para el curso (p.ej. guane01, confirma con el profesor cuál está disponible durante el curso):

:::console
ssh estudiante03@guane01 -L9903:localhost:9903

Si es la primera vez que entras, crea una copia del repositorio de ejercicios para poder trabajarlos de manera independiente

:::console
git clone https://bitbucket.org/rramosp/ucaldas.20142.msc

Lanza tu servidor personal de notebooks de ipython:

:::console
ipython notebook --port 9903 --no-browser

Abre la siguiente dirección en un browser de tu computadora de escritorio

:::console
http://localhost:9903

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Language:Jupyter Notebook 99.2%Language:C 0.5%Language:Python 0.2%Language:Roff 0.1%