dionys / genetic-tools

Утилиты для обработки данных генетических тестов

Утилиты для обработки данных генетических тестов

• bin/myheritage-to-ysnps.pl

  Конвертирует сырые (raw) данные аутосомного теста MyHeritage в список SNP Y-хромосомы, связанных с гаплогруппами. В дальнейшем этот список можно использовать для выяснения гаплогруппы, например, с помощью утилиты Y-SNP Subclade Predictor.

  Использование:

  bin/myheritage-to-ysnps.pl <raw-файл> <index-файл>
  

  где

  • <raw-файл> — распакованный файл с сырыми данными MyHeritage;
  • <index-файл> — файл со списком SNP Y-хромосомы от ISOGG.

  Второй файл можно получить, запустив скрипт bin/fetch-isogg-ysnp-index.sh, или скачать самостоятельно с сайта ISOGG (в формате TSV).