FilterSignal2020
Filter for electrophysiological signals of plants and plot of graphs (Autocorrelation, Density, RAW signal, Filtered signal, FFT, PSD, Lag Scatter)
The program uses the name.txt file to analyze several electrophysiological data files, using the following steps:
1 - Remove the frequencies above, below and noise
2 - Filter the data using the scipy.signal.filtfilt library (https://docs.scipy.org/doc/scipy-0.18.1/reference/generated/scipy.signal.filtfilt.html)
3 - Plot the graphs using the filtered data (Autocorrelation, Density, RAW signal, Filtered signal, FFT, PSD, Lag Scatter)
Use
For use, fill in the name.txt file with the names of the files where the raw data is located. If the data contains more than one column (Ex: OpenBCI) check the variable 'column' to ensure that the data will be read correctly.
Meta
Thiago Carvalho – @destritux – destritux@gmail.com
Distributed under the MIT license. See LICENSE for more information.
Filtro para sinais eletrofisiologicos de plantas e Plot de graficos (Autocorrelação, Densidade, sinal RAW, sinal Filtrado, FFT, PSD, Lag Scatter)
O programa utiliza do arquivo name.txt para analizar varios arquivos de dados eletrofisiologico, através dos seguintes passos:
1 - Retira as frequências acima, abaixo e ruido
2 - Filtra os dados utilizando a biblioteca scipy.signal.filtfilt (https://docs.scipy.org/doc/scipy-0.18.1/reference/generated/scipy.signal.filtfilt.html)
3 - Plota os graficos utilizando os dados filtrados (Autocorrelation, Density, RAW signal, Filtered signal, FFT, PSD, Lag Scatter)
Exemplo de uso
Para uso, preencha o arquivo name.txt com os nome dos arquivos onde encontra-se os dados brutos. Caso os dados contenham mais de uma coluna (Ex: OpenBCI) verifique a variavel 'coluna' para garantia de que os dados seram lidos corretamente.
Meta
Thiago Carvalho – @destritux – destritux@gmail.com
Distribuído sob a licença MIT. Veja LICENSE para mais informações.