dakesan / q2_clawback_test

q2_clawback_test

How I reached to this information

• ribosome配列のnaive-bayes classifierしたい
• q2-classifierの精確性を高めたい系の最新の試みがあることを知る
  • https://www.nature.com/articles/s41467-019-12669-6
• q2-clawbackを使っているらしい
• GTDBでも同じこと使用している奴がいる
  • https://forum.qiime2.org/t/plugin-error-from-clawback-taxonomy-classification-does-not-match-reference-taxonomy/22089

Discontinued

それなりにユーザーはいるみたいだけれども、どうにも私の環境では動作しなかった。

動作が不安定で、依存先のredbiomでも構文エラーを吐いてくる。ちょっと安定した運用は難しそうなので棚上げする。