bClemot-Sc / msc-advanced-statistical-analysis-project

[FR] Data analysis on parameters influencing body temperature in butterfly flight.

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Projet-ASA

Présentation du projet

Collaborateurs : Bastien Clémot, Raphaëlle Lebailly, Chloé Pérou, Pierre-Alexandre Quittet

Projet de groupe pour l'UE 'Advanced Statistical Analysis' dans le cadre du Master 2 MODE (Modélisation en Ecologie).

Manipulation d'un tableau de données sur l'étude de l'effet du génotype, du métabolisme et des conditions environnementales sur les conditions thermiques du vol des papillons. L'espèce de papillon est Melitaeria cinxia, étudiée dans des conditions semi-naturelle dans des cages extérieures. On s'intéresse à la température des papillons lors du vol sous 3 aspects :

  • Métabolisme
  • Conditions environnementales
  • Génétique : gènes candidats de réponses au stress

Nous nous attendons à voir un effet de ces trois types de variables, en particulier de gènes. En effet, selon la littérature :

  • Un génotype 'AC' pour SNP 331 est associé à de plus grandes performances métaboliques à une faible température corporelle
  • Un génotype 'AA' pour SNP 331 est associé avec un faible taux métabolique durant le vol à température moyenne mais de bonnes performances pour de fortes températures
  • Des différences d'expression de la Heat shock protein sur la protéine gpi

Organisation des fichiers

  • ASA_PROJECT_SCRIPT_MD.Rmd : fichier RMarkdown avec les analyses complètes
  • ASA_PROJECT_SCRIPT_MD.html : fichier htlm avec les analyses complètes
  • ASA_data_projet.txt : Tableau de données à analyser sous format texte
  • data_butterfly.xlsx : Tableau de données à analyser sous format excel
  • Article_data_Mattila_2015.pdf : pdf de l'article sur lequel se base l'étude

About

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