andrematte / epidemic-simulator

Agent based epidemic simulation, developed using the NetLogo simulator. Class Project.

Simulação Epidemiológica Baseada em Agentes

PPGEE0260: Modelagem e Simulação Discreta de Sistemas Aluno: Carlos André de Mattos Teixeira

Código baseado em: https://github.com/YangZhouCSS/Four_models

Descrição do Projeto

Objetivo: Simular a evolução de uma epidemia ao longo do tempo com base no modelo SIR. Propor soluções baseadas no comportamento das curvas de infecção.

• Abordagem de simulação baseada em agentes.
• Simulação de diferentes cenários (taxas de infeção)

Questionamentos:

• Considerando uma população finita e o Modelo SIR, qual o impacto da taxa de infecção no comportamento da epidemia?
• Quantos % da população é infectada simultaneamente? Como isso impacta o sistema de saúde?
• Como realizar o "achatamento da curva"?

Requisitos de Execução

• Instalação do software NetLogo.
• Opcional: A análise dos resultados é gerada utilizando o software Jupyter Notebook.

Instruções de Execução

• Executar o arquivo simulation.nlogo.
• Utilizar os sliders para selecionar as configurações de simulação desejadas.
• Pressionar o botão Executar para rodar a simulação.
• Opcional:
  • Salvar os resultados em arquivos csv (clicar com o botão direito nos gráficos de simulação.
  • Executar o arquivo results.ipynb para gerar os gráficos de resultados.

Referências

[1] Khalil, K. et. al. (2010, April). An agent-based modelling for pandemic influenza in Egypt. Informatics and Systems.

[2] Stevens, H. (2020, March 14). Why outbreaks like coronavirus spread exponentially, and how to flatten the curve. The Washington Post. Retrieved November 20, 2021, from https://www.washingtonpost.com/graphics/2020/world/corona-simulator/.

[3] Wilensky, U. (2016). NetLogo. NetLogo. Retrieved November 12, 2021, from http://ccl.northwestern.edu/netlogo/.

[4] Wikimedia Foundation. (2020, October 2). Modelo Epidêmico. Wikipedia. Retrieved October 29, 2021, from https://pt.wikipedia.org/wiki/Modelo_epid%C3%AAmico.

[5] Zhou, Y. (2017, June 3). Comparing four modeling approaches: System Dynamics, agent-based modeling, cellular automata, and discrete event simulation using a SIR model as an example. Comparing four modeling approaches: System Dynamics, Agent-based Modeling, Cellular Automata, and Discrete Event Simulation using a SIR model as an example. Retrieved October 29, 2021, from http://geospatialcss.blogspot.com/2017/06/comparing-four-modeling-approaches.html.