Manual básico de R (https://aprendiendo-r-intro.netlify.app) diseñado para empezar desde cero, elaborado por Javier Álvarez Liébana. Dicho manual/tutorial ha sido elaborado en R Markdown y bookdown. Puedes ver un resumen de las funcionalidades de dicho paquete, así como de otros documentados por el equipo de R Studio en sus esquemas resumen.
install.packages("bookdown")
# o desde su versión en desarrollo actualizada
# devtools::install_github("rstudio/bookdown")