A futtatáshoz meg kell adni a jar fájlokat. Én Eclipse-et használtam. Ott jobb klikk a projektre -> Build Path -> Configure Build Path... -> Libraries -> Add External JARs... és kiválasztani a két mellékelt jar fájlt. Ezen kívül ugyanitt (a hozzáadás után) glpk-java.jar melletti nyílra rákattintani -> Native library location és megadni a w64 mappát.