Reproducibility-FBB-MSU / FreePSI

Трифонова, Волобуева

Geek Repo:Geek Repo

Github PK Tool:Github PK Tool

FreePSI

авторы - Волобуева, Трифонова

Этот проект посвящен реализации алгоритма "FreePSI" на симулированных данных, которые были получены при помощи алгоритма flux simulator.

Код запуска алгоритма "FreePSI" скрипт "FreePSI.sh", данные с полученными PSI в файле "psi_freePSI.summary", данные о истинных значения PSI лежат в файле "TruePSI". Скрипт, который строит scatter plot для genome-wide оценки PSI файл "genome-wide.ipynb"(на вход подается файл TruePSI, psi_FreePSI.summary), полученная картинка "genome-wide.png".

About

Трифонова, Волобуева


Languages

Language:Jupyter Notebook 96.7%Language:Shell 3.3%