本项目的主要目标是解析gatk-sv项目内的GATKSVPipelineBatch.wdl文件 并将文件替换为相应的shell脚本 涉及测试脚本、流程图、工具学习等相关信息
参考项目的github地址:https://github.com/broadinstitute/gatk-sv
测试数据选取SAMPLE_ID为HG0096的样本,所有文件均有google cloud下载。 参考基因组:部分选取hs37d5,部分选取hg38
本项目的主要目标是解析gatk-sv项目内的GATKSVPipelineBatch.wdl文件 并将文件替换为相应的shell脚本 涉及测试脚本、流程图、工具学习等相关信息
参考项目的github地址:https://github.com/broadinstitute/gatk-sv
测试数据选取SAMPLE_ID为HG0096的样本,所有文件均有google cloud下载。 参考基因组:部分选取hs37d5,部分选取hg38