rdkit_summary
rdkit总结与记录
分子读取、输出与可视化
read_write_visualize.ipynb
3D构象生成
3D_conformers_generation.ipynb
高亮展示分子中匹配的子结构
substructure_search_and_highlight.ipynb
搜索侧链符合某种条件的子结构
substructure_that_meet_criteria.ipynb
SMARTS规则速查表
SMARTS_cheatsheet.md
子结构删除、替换、切割操作
substructure_delete_replace_split.ipynb
摩根分子指纹计算、提取、可视化
Morgan_Fingerprints_generate_visualize.ipynb
最大公共子结构,MCS搜索与参数介绍
MCS.ipynb
各类分子指纹、相似性度量、多样化分子库构建
FP_similarity_and_application.ipynb
分子描述符计算与可视化
descriptor_calculate_visualize.ipynb
化学特征、药效团提取与2D药效团指纹计算
features_pharmacophores_2D_FP.ipynb
分子片段、片段指纹、指纹重要性分析
fragments_FP_and_analysis.ipynb
骨架分解、侧链分离
scaffold_and_side_chain_decomposition.ipynb
化学反应操作与处理
chemical_reaction.ipynb
在化学反应中对原子进行保护
protect_atoms_in_reaction.ipynb
通过Recap和BRICS进行分子拆解与合成
recap_brics_decompose_build.ipynb
原子、键、环操作与药效团查找
atom_bond_ring_and_pharmacophore_search.ipynb
分子修改与编辑
modifying_molecules.ipynb
python操作postgresql数据库与自动导入分子
postgresql_by_psycopg2.ipynb
在PostgreSQL中进行分子结构搜索与查询
postgresql_substructure_search.ipynb
在PostgreSQL中进行分子相似性搜索
postgresql_similarity_search.ipynb
使用rdMolDraw2D模块设置并绘制分子
rdMolDraw2D_for_png_svg.ipynb