KamilSuchanek95 / micaff

MicAff is a genomic data analysis tool. Application made with Shiny. It is used to analyze the data from the microarray experiment. Running on a local server, it allows you to load CEL data, their initial processing and further analysis.

Geek Repo:Geek Repo

Github PK Tool:Github PK Tool

Narzędzie do analizy danych genomicznych - MicAff.

Aplikacja stworzona przy pomocy Shiny-R. Służy do przykładowej analizy danych, pochodzących z eksperymentu mikromacierzowego.

Narzędzie umożliwia:

  • Odczytanie plików .CEL
  • Przetwarzanie wstępne (podsumowanie sond i normalizację)
  • Kontrolę jakości
  • Wizualizację danych
  • Obliczenie statystyk z ewentualną korektą wartości p
  • Typowanie istotnych genów zgodnie z zadanymi kryteriami
  • Przedstawienie ewentualnych wzorców
  • Pobranie danych po normalizacji oraz wykonanych statystyk

Przykładowy przebieg pracy aplikacji:

youtube.com

example

About

MicAff is a genomic data analysis tool. Application made with Shiny. It is used to analyze the data from the microarray experiment. Running on a local server, it allows you to load CEL data, their initial processing and further analysis.

License:The Unlicense


Languages

Language:R 99.1%Language:Ruby 0.9%