Curso Python para BioInformática - Udemy
Projeto realizado durante o curso "Introdução à Programação para Bioinformática com Python" da Alfahelix Treinamentos na Udemy.
📝 Tudo que Aprendi
Python Básico
Foi ensinado o basico de programação com Python, como variaveis, operadores, laços de repetição, condições e o comando "input" do python.
Python Intermediário
Foi ensinado a usar Listas, Strings, Regex, Ler/Escrever Arquivos, Tratar Exceções, Gerar numeros aleatorios, básico de Orientação a objetos e modularização.
Python Avançado
Foi Ensinado a usar List Comprehension, Enumerates, Filter, Reduce, Map, Lambda e Zip.
BioPython
Foi ensinado a baixar, configurar e utilizar o BioPython para fazer traduções e transcrições, manipular sequencias de proteinas e DNA, e mecher com arquivos FASTA.
Visualização de dados para Bioinformática
Foi ensinado a como fazer a visualização de dados, foi utilizado RNA ribossomal entre humanos e bactérias como exemplo.
Construção de pipelines para Bioinformática
Foi ensinado a criar pipelines com python, como executar programas externos com Python, como baixar, instalar e configurar o MODELLER, como utilizar o Clustal W, e alinhar sequencias com o BLAST.
Projetos
- Pasta 1python-basico: Projeto aonde foi ensinado o basico de Python.
- Pasta 2python-intermediario: Projeto aonde foi ensinado o intermediario de Python.
- Pasta 3python-avancado: Projeto aonde foi ensinado o avançado de Python.
- Pasta 4biopython: Projeto aonde foi ensinado a utilizar o BioPython.
- Pasta 5visualizacaodedados: Projeto aonde foi ensinado a visualizar os dados da bioinformática.
- Pasta 6pipelines: Projeto aonde foi ensinado a criar Pipelines e utilizar MODELLER, Clustal W e o Blast.
👨🏫 Testando
🚩 Foi utilizado o Python 3.8 (64 Bits)
Só executar o arquivo desejado.