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Proyecto personal de análisis de datos con control de versiones

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Título

Análisis de pátrones fisiquímicos en metaloproteasas queratinolíticas para su bioprospección genómica.

Autor

Eduardo Sanchez Carvajal

Descripción del problema a resolver

Diversas bacterias han sido reconocidas como importantes productoras de queratinasas, enzimas relevantes para el tratamiento y revalorización de los desechos de plumas generados por la industria avícola. Sin embargo, el mecanismo de degradación de la queratina por parte de estas aún no ha sido completamente dilucidado. Dado lo anterior, tampoco se han descrito a la fecha patrones moleculares que faciliten la identificación de enzimas con actividad queratinolítica, los cuales puedan facilitar su bioprospección in silico. La intención de analizar estos datos es identificar tendencias o patrones en dichos parametros que permitan predecir la actividad queratinolítica en metaloproteasas mediante minado genómico.

Variables de estudio, factores a analizar y número total de observaciones

Esta base de datos colecta un total de 36 observaciones obtenidas mediante análisis bioinformático y de la base de datos de proteasas MEROPS, sobre tipo de queratinolisis, sitios de unión a metales y activos, peso molecular, punto isoeléctrico, residuos con carga positiva y negativa, coeficiente de extinción, índice de inestabilidad, índice alifático y Gran Promedio de Hidropatía (GRAVY) como variables de estudio, correspondientes a 36 metaloproteasas, clasificadas mediante los factores de actividad queratinolítica y familia de proteasas a la que pertenecen.

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