AnthonyUdovichenko / hse21_H3K36me3_ZDNA_mouse

hse21_H3K36me3_ZDNA_mouse

Выполнил Удовиченко Антон

Сохранённая сессия в UCSC GenomeBrowser: http://genome.ucsc.edu/s/udovichenko/hse21_H3K36me3_ZDNA_mouse

Анализ пиков гистоновой метки

Гистограммы длин участков

ENCFF493MPV:

mm9 — 201650 пиков.

mm10 — 201749 пиков.

ENCFF827GCP:

mm9 — 136973 пика.

mm10 — 137045 пиков.

Фильтрация

Отфильтрованы пики ≥ 5000.

Гистограмма длин участков после фильтрации

ENCFF493MPV:

mm9 — 196224 пика.

mm10 — 196319 пиков.

ENCFF827GCP:

mm9 — 136647 пиков.

mm10 — 136718 пиков.

Где располагаются пики гистоновой метки относительно аннотированных генов

ENCFF493MPV:

mm9:

mm10:

ENCFF827GCP:

mm9:

mm10:

Анализ участков вторичной структуры ДНК

Гистограмма длин участков

mouseZ-DNA1 — 3258 пиков.

Где располагаются участки структуры ДНК относительно аннотированных генов

Анализ пересечений гистоновой метки и структуры ДНК

Гистограмма длин участков

intersect — 342 пика.

Где располагаются пересечения

Скриншот с пересечением из геномного браузера

chr1:75,387,967-75,388,496

Ассоциация пересечений

Количество пиков, которые удалось проассоциировать с генами: 39.

Общее количество уникальных генов: 29.

GO-анализ

Статистически значимых результатов нет.