AIRI-Institute / GENA_Web_docker

Установка приложения

• git clone https://gitlab.2a2i.org/bioinformatics/dnalm-docker.git
• make app-init
  скачивается и собирается frontend приложение, скачивается backend приложение, создаётся .env файл из примера
• положить в проект файл с весами backend/src/spliceai/data/checkpoints/spliceai/model_best.pth
• docker-compose up -d

Команды для работы с frontend приложением

Выполняются в контейнере node (docker-compose exec node sh или make app-node)

• make app-build - сборка приложения (доступно и из корня проекта)
• npm i && npm run build - сборка приложения
• npm run build - сборка приложения, если просто npm i уже запускался

Конфигурационные файлы приложения

./.env - настройка портов docker приложения:
при изменении необходимо перезапускать контейнеры

• NGINX_PORT=80 (порт nginx)

Внутренние порты приложения

• Nginx: 80
• Backend: 3000

Обновление моделей

Для обновления кода моделей из репозитория и перезапуска всех контейнеров необходимо запустить команду:

• sudo make backend-restart

Получение логов

Для получения логов по конкретной модели необходимо запустить команду

• sudo docker-compose logs --tail=N containerName

где N - это количество строк с конца для вывода(N = 100 - 100 последних строк из лога), containerName - название контейнера (названия контейнеров можно посмотреть в docker-compose.yaml в корне проекта)