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Meidcal Image Segmentation Pytorch Version

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ROI区域代码请教

DiahannWu opened this issue · comments

由于结节在图像中心位置,且目标比较小,所以根据LIDC-IDRI_1176.npy文件中结节的直径大小,在128x128x64大小上获取肺结节ROI区域图像,这样就可以进一步减少背景干扰,因此得到肺结节的ROI区域。然后统计全部肺结节ROI区域的大小,平均大小是33x33x18。
请问这里获取ROI区域的代码能分享一下吗

ROI是根据直径来计算得到的,很简单

这里图像的(128x128x64)已经是对应物理坐标了吗,所以先根据LIDC-IDRI_1176.npy文件中结节的直径大小/spacing得到物理直径,然后roi_image为[64-直径/2:64+直径,64-直径/2:64+直径,32-直径/2:32+直径]吗?

@DiahannWu 为了考虑到结节和附近的背景区域,我建议roi_image为[64-直径:64+直径,64-直径:64+直径,32-直径:32+直径]

@DiahannWu 为了考虑到结节和附近的背景区域,我建议roi_image为[64-直径:64+直径,64-直径:64+直径,32-直径:32+直径]

好的,非常感谢大佬