hewm2008 / VCF2PCACluster

A new simple and efficient software to PCA and Cluster For popolation VCF File

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请问 eigenval 文件是否代表每个 PC 的解释比例

luckyvivi opened this issue · comments

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请问作者大大 eigenval 文件是否代表每个 PC 的解释比例,如果是的话,是不是我的样本 PC1/2/3 都有些太小了!谢谢!

是的 是每个 PC 的解释比例 。样品多 和 没有明显的分群的话 这个比例就低。 你这说明你这些样品没有明显分群

画图 Plot2Deig 加 -ShowEval 就 可以显示多这个贡献度