La definición de "comando" se hace *después* de la primera mención y además incluye términos no definidos.

[Juan Julián Merelo Guervós]

Aquí:

matroos/doc/tex/secciones/01_introduccion.tex

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 Los comandos son órdenes que puede ejecutar el bot a voluntad del usuario en cualquier momento, y que se ejecutan en el contexto actual donde se encuentre interactuando un usuario con el bot. Usualmente estos comandos se invocan haciendo uso de una palabra clave, aunque pueden ser también tareas fijas y establecidas ejecutadas de manera automática sin intervención de un usuario. 

Si los comandos son órdenes "a voluntad del usuario", ¿los bots que hacen una sola cosa repetidamente no son bots? ¿Cuál es "el contexto actual"? ¿Es el del bot o es algún otro contexto? ¿Puedes ejecutar una orden del shell desde un bot? ¿Si alguien manda un comando a un bot en un grupo, ese bot va a ejecutarse en el contexto de quién?

En el resto de la memoria, "comandos" parecen ser simplemente tareas. Por ejemplo, cuando hablas de "comandos" que se ejecutan periódicamente, no lo hacen como respuesta al usuario, sino simplemente realizando una serie de tareas predeterminadas.

No te estoy diciendo que contestes a estas preguntas, te estoy repitiendo lo mismo de siempre: se parte de un problema. Si no partes de un problema, no sabes qué solución cubre mejor ese problema.