【全书】代码升级
XiangyunHuang opened this issue · comments
搬迁工作完成，即宣告替换/修复完书中不能运行的代码，接下来是代码升级，指的是书中的代码可以运行，但是代码中包含的 R 包作者已经不维护或者停止维护，这类代码可以更新升级，考虑到本书风格偏向 Base R， 我们可以将数据操作尽量限定在这个范围，当然可以有 tidyverse 风格，但是我想把它放在第二版的现代统计图形中，这个有点类似于第一版的 Advanced R 和第二版的 Advanced R 的做法 --- 在讲同一个东西，但是基于不同的工具在讲
现在举例解释何为第一版现代统计图形的代码升级，比如这一段代码（位于第4章第29小节交互效应图）
# ddply 在 plyr 包中，cast 在 reshape 包中
library(plyr)
library(reshape)
tbl <- ddply(esoph, agegp ~ alcgp, summarise, mean(ncases / (ncases + ncontrols)))
cast(tbl, agegp ~ alcgp)其中 plyr 和 reshape 包都处于维护模式，不再更新了，作者也不推荐使用了，这个升级工作一个走 dplyr 或者 data.table，另一个走 Base R，这样做的目的是希望代码能在相当一段时间内是稳定的，减少后期维护成本。就这本书而言，没有什么大数据， Base R 提供的数据操作足以应付，文风也能统一，我倾向于这个 Base R
事实上，引入的两个依赖可去掉，替换后代码如下
tbl <- aggregate(ncases / (ncases + ncontrols) ~ agegp * alcgp, data = esoph, mean)
colnames(tbl) <- c("agegp", "alcgp", "mean")
reshape(tbl, timevar = "alcgp", idvar = "agegp", direction = "wide", sep = "_")#29 也属于此类，但是我想把它放在第二版中，主要是工作量会很大，全书代码改动比较多，基本上也是纯体力劳动
阶段性胜利！建议来个 release。
把问题 #28 搞完就可以先放出来一版
@pzhaonet 把图库一章的文本格式再统一一下吧，我把代码格式和过时的替换了一遍，比如上面提到的代码问题
图5.2 绘制失败，代码不需要更新，只是需要加装包 hexbin。
@liechi 谢谢反馈，已修正
已经做完