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dump dicom rtss to png

使用 DICOM RTSS 標記檔把對應 DICOM 影像的輪廓匯出成 PNG 檔案

必要環境

• JAVA JDK (dcm4che)
  • 用於把 DICOM 影像轉成 PNG 檔
• python
  • 用於把 contour 匯出成 PNG 檔
• node.js
  • 用於匯出 DICOM RTSS 以及 DICOM 檔的對應資訊

安裝套件

• 安裝 python 套件

pip install -r requirements.txt

• 安裝 node.js 套件

npm install

使用步驟

Step 1 匯出 DICOM RTSS 以及 DICOM 檔的對應資訊

• 使用以下指令匯出

node index.js -d dirPath -o xxx.csv

• 另外如果您想順便將 DICOM 轉成 PNG 檔案可以加入 --dcm2img

node index.js -d dirPath -o xxx.csv --dcm2img

Note

• 請將 dirPath 轉換成您含有 DICOM 檔案的資料夾路徑
• 請將 xxx.csv 轉換成您想匯出的 csv 檔案路徑
• 完成後將會有 xxx.csv, xxx-contour-obj.json, xxx-non-contour-obj.json 檔案

Step 2 匯出 DICOM RTSS 的 contour PNG

• 使用以下指令匯出

python python/dump_contour.py -i ./xxx-contour-obj.json -nf ./xxx-non-contour-obj.json

Note

• 請將 xxx-contour-obj.json 以及 xxx-non-contour-obj.json 替換成您上一步驟匯出的 json 檔案名稱

產生結果

• 產生結果如下 (含 dcm2img)